物质的颜色、沸点等性质与其分子结构有没有直接关系

物质的颜色与结构有关.我们看到的物质的颜色是物质吸收太阳光的部分可见光以后剩余光的颜色,物质吸收可见光的波长取决于它的分子结构,比如各种有机染料,之所以颜色不同,是因为分子中Pi键共轭体系的大小不一样,或其中电子的跃迁能级大小不一样.
物理性质中的熔沸点主要是和分子的分子量以及分子间的作用理大小有关,分子量越大的,一般沸点越高,比如溴化氢的沸点就比氯化氢的高（范德化作用）.沸点越高.分子间作用力越强,比如水的沸点就比硫化氢的高（氢键）.在此也可以看得出氢键的影响更大些.
理论计算只能比较沸点相对大小,不能求的实际沸点高低.至于颜色,理论上可以计算,问题在于使用的算法不一样得到的结果也会有一定的差异,也就是说理论计算只是提供参考.