生态学的研究方法可以分为野外的（田间的）、实验的和理论的三大类.
野外的研究方法是首先的,并且是第一性的.但是采集数据时各种误差较大,而且野外条件下影响因子很多我们关注的未必就是关键性的因子,从而得出不正确结论.
实验研究是分析因果关系的一种有用的补充手段,实验研究的优点是条件控制严格,对结果分析比较可靠,重复性强,但实验室条件不可能完全模拟野外自然状态,因此这些数据的规律在野外条件下可能不成立.
利用数学模型进行模拟研究是理论研究最常用的方法.模型研究的预测,必须通过现实来检验其预测结果是否正确,同时,也可以通过修改参数再进行模拟,使模型研究逐步逼近现实.同样的原因,模型关注的通常也是一些因子而不是全部,结论只是近似而达不到准确.
