生物多样性丧失的原因主要有基因多样性的丧失和生态系统遭到破坏等
1.生物多样性
物种多样性是群落生物组成结构的重要指标,它不仅可以反映群落组织化水平,而且可以通过结构与功能的关系间接反映群落功能的特征.
生物群落多样性研究始于本世纪初叶,当时的工作主要集中于群落中物种面积关系的探讨和物种多度关系的研究.1943年,Williams在研究鳞翅目昆虫物种多样性时,首次提出了"多样性指数"的概念,之后大量有关群落物种多样性的概念、原理、及测度方法的论文和专著被发表,形成了大量的物种多样性指数,一度给群落多样性的测度造成了一定混乱.自70年代以后,Whittaker（1972）、Pielou（1975）、Washington（1984）和Magurran（1988）等对生物群落多样性测度方法进行了比较全面的综述,对这一领域的发展起到了积极的推动作用.
生物多样性通常包含三层含义,即生态系统多样性、物种多样性和遗传多样性.狭义的遗传多样性是指物种的种内个体或种群间的遗传（基因）变化,亦称为基因多样性.广义的遗传多样性是指地球上所有生物的遗传信息的总和.物种多样性是指一定区域内生物钟类（包括动物、植物、微生物）的丰富性,即物种水平的生物多样性及其变化,包括一定区域内生物区系的状况（如受威胁状况和特有性等）、形成、演化、分布格局及其维持机制等.生态系统多样性是指生物群落及其生态过程的多样性,以及生态系统的内生境差异、生态过程变化的多样性等.
从目前来看,生物群落的物种多样性指数可分为α多样性指数、β多样性指数和γ多样性指数三类.α多样性指数包含两方面的含义：①群落所含物种的多寡,即物种丰富度；②群落中各个种的相对密度,即物种均匀度.β多样性指数可以定义为沿着环境梯度的变化物种替代的程度.不同群落或某环境梯度上不同点之间的共有种越少,β多样性越大.精确地测定β多样性具有重要的意义.这是因为：①它可以指示生境被物种隔离的程度；②β多样性的测定值可以用来比较不同地段的生境多样性；③β多样性与α多样性一起构成了总体多样性或一定地段的生物异质性.
群落物种多样性是梯度变化的.群落物种多样性的变化特征是指群落组织水平上物种多样性的大小随某一生态因子梯度有规律的变化.①纬度梯度：从热带到两极随着纬度的增加,生物群落的物种多样性有逐渐减少的趋势.如北半球从南到北,随着纬度的增加,植物群落依次出现为热带雨林、亚热带常绿阔叶林、温带落叶阔叶林、寒温带针叶林、寒带苔原,伴随着植物群落有规律的变化,物种丰富度和多样性逐渐降低.②海拔梯度：随着海拔的升高,在温度、水分、风力、光照和土壤等因子的综合作用下,生物群落表现出明显的垂直地带性分布规律,在大多数情况下物种多样性与海拔高度呈伏相关,即随着海拔高度的升高,群落物种多样性逐渐降低.如喜马拉雅山维管植物物种多样性的变化,就表现了这样的规律.③环境梯度：群落物种多样性与环境梯度之间的关系,有的时候表现明显,而有的时候则表现不明显.如Gartlan（1986）研究发现土壤中P、Mg、K的水平与热带植物群落物种多样性之间存在着显著的关系.Gentry（1982）对植物群落物种多样性进行的研究表明,在新热带森林类型,物种多样性与年降雨量呈显著正相关,而在热带亚洲森林类型,两者则不存在相关关系.④时间梯度：大多数研究表明,在群落演替的早期,随着演替的进展,物种多样性增加.在群落演替的后期当群落中出现非常强的优势种时,多样性会降低.
海南:
鹦哥岭省级自然保护区是东南亚最大的原始热带雨林,是中国热带资源最丰富的地区之一,在保护区内大规模造林,严重破坏了保护区的生态环境和生物多样性,为进一步保护好该区的原始森林和生物资源,国家林业局保护司已经于2006年7月下文,要求海南省林业局调查处理此事.经跟踪了解,目前正在进一步调查之中,就这样一个意见.
