甲生物核酸的碱基比例为：嘌呤占46%、嘧啶占54%，乙生物遗传物质的碱基比例为：嘌呤占34%、嘧啶占66%，则以下分别表

A、变形虫的遗传物质是DNA，因此乙不可能是变形虫，A错误；
B、T₂噬菌体的核酸只有DNA，因此甲不可能是噬菌体，豌豆的遗传物质是DNA，因此乙不可能是豌豆，B错误；
C、绵羊的遗传物质是DNA，因此乙不可能是绵羊，C错误；
D、肺炎双球菌既含有DNA也含有RNA，核酸中的嘌呤与嘧啶可能不相等，烟草花叶病毒的遗传物质是RNA，RNA是单链结构，嘌呤与嘧啶可能不相等，D正确．
故选：D．