放线菌或真菌组成其菌丝体的基本单位.放线菌的菌丝细胞纤细、无隔、分枝.真菌的菌丝较粗、有分枝,其中少数无隔、多核,如鞭毛菌亚门和接合菌亚门的低等真菌；多数有隔、单核或少核,如子囊菌亚门、半知菌亚门和担子菌亚门的高等真菌.菌丝通过顶端生长而延伸,通过侧生而分枝.埋入基质中以吸取营养为主的菌丝称营养菌丝,有的种类还可分化成假根、吸器等构造；伸展在空间的菌丝称气生菌丝,成熟后可分化成各种形式的产孢子构造,如放线菌的孢子丝或真菌中的子实体.菌丝具有无性繁殖功能,可用于接种、扩大.
菌丝粉从根本上保存了植物的有效成分和活性,可直接食用,易被人体吸收.
菌丝的分类
基内菌丝
基内菌丝匍匐生长于营养基质表面或伸向基质内部,它们象植物的根一样,具有吸收水分和养分的功能.有些还能产生各种色素,把培养基染成各种美丽的颜色.放线菌中多数种类的基内菌丝无隔膜,不断裂,如链霉菌属和小单孢菌属等；但有一类放线菌,如诺卡氏菌型放线菌的基内菌丝生长一定时间后形成横隔膜,继而断裂成球状或杆状小体.
气生菌丝
气生菌丝是基内菌丝长出培养基外并伸向空间的菌丝.在显微镜下观察时,一般气生菌丝颜色较深,比基内菌丝粗；而基内菌丝色浅、发亮.有些放线菌气生菌丝发达,有些则稀疏,还有的种类无气生菌丝.
孢子丝
孢子丝是当气生菌丝发育到一定程度,其上分化出的可形成孢子的菌丝.放线菌孢子丝的形态多样,有直形、波曲、钩状、螺旋状、一级轮生和二级轮生等多种,是放线菌定种的重要标志之一.孢子丝发育到一定阶段便分化为分生孢子.在光学显微镜下,孢子呈圆形、椭圆形、杆状、圆柱状、瓜子状、梭状和半月状等,孢子的颜色十分丰富.孢子表面的纹饰因种而异,在电子显微镜下清晰可见,有的光滑,有的褶皱状、疣状、刺状、毛发状或鳞片状,刺又有粗细、大小、长短和疏密之分.
