经典遗传学基因的概念：基因具有下列共性：（1）基因具有染色体的重要特征（即基因位于染色体上）,能自我复制,相对稳定,在有私分裂和减数分裂时,有规律地进行分配；（2）基因在染色体上占有一定的位置（即位点）,并且是交换的最小单位,即在重组时不能再分割的单位：（3）基因是以一个整体进行突变的,故它是一个突变单位；（4）基因是一个功能单位,它控制正在发育有机体的某一个或某些性状,如白花、红花等.
总之,经典遗传学认为基因是一个最小的单位,不能分割,既是结构单位,又是功能单位.
分子遗传学关于基因的概念：分子遗传学的发展揭示了遗传密码的秘密,使基因的概念落实到具体的物质上,即基因在DNA分子上,一个基因相当于DNA分子上的一定区段,它携带有特定的遗传信息.这类遗传信息或被转录为RNA,包括信使RNA、转移RNA、核糖体RNA；或者信使RNA被翻译成多肽链.
另一方面,在精细的微生物遗传分析中查明,基因并不是不可分割的最小单位,而是远为复杂得多的遗传和变异的单位.
随着现代遗传学的发展,在分子水平上,根据重组、突变和功能将基因分成3个单位：
（1）突变子：就是指性状突变时产生突变的最小单位.一个突变子可以小到只有一个碱基对；
（2）重组子：就是指性状重组时,可交换的最小单位.一个交换子可以只包含一个碱基对；
（3）顺反子：表示一个起作用的单位,基本符合通常所述的基因的大小或略小.它包括它包括一段DNA与一个多肽链合成相对应,平均为500-1500个碱基对.
经典遗传学作为结构单位的基因,实际上包含大量的突变子或重组子.经典遗传学认为基因是最小的结构单位已经不能成立了,然而关于基因是一个功能单位的概念仍然是正确的.基因的概念是（1）可转录一条完整的RNA分子,或编码一条多肽链；（2）功能上被顺反测验或互补测验所规定.也就是说,基因相当于一个顺反子,包含许多突变子和重组子.
