在NCBI中,如何获取一个物种的所有蛋白质序列和二级结构

问题描述:

在NCBI中,如何获取一个物种的所有蛋白质序列和二级结构
1个回答 分类:生物 2014-09-18

问题解答:

我来补答
我可以告诉你,那是不可以能的.一个物种所包含的蛋白质有多少种?NCBI中储存的数据是按照单个蛋白质序列贮存的,而且都只是序列,NCBI不是二级结构数据库,要找二级结构去PDB找,在说了,就算你找到了所有的某个物种的所有蛋白质序列,您也基本上不可能找到所有对应的二级结构,因为PDB中已经测定的二级结构于NCBI已经测序的序列,那简直就相差太多了.二级结构目前已经准确则需的大概1.3W中蛋白质,而NCBI中的序列数据的一个月增长速度也许都要比这个高.所以LZ所说的基本上是不可能的,主要是二级结构
 
 
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