动物学者根据细胞数量及分化、体型、胚层、体腔、体节、附肢以及内部器官的布局和特点等,将整个动物界分为若干门,有的门大,包括种类多,有的则是小门,包括种类很少.正如前面已指出的种以上各阶元既具有客观性又具有主观性,学者们对于动物门的数目及各门动物在动物进化系统上的位置持有不同的见解,并根据新的准则、新的证据,不断提出新的观点.例如,腹毛类和轮虫,有的人各立为门,也有的将它们列入线形动物门中,作为纲；原气管动物为节肢动物门中的一个纲,但也有人将其等级提升为门,在分类系统上置于环节动物之前的位置上；对于软体动物在分类系统上,位置的排列也有不同的意见.近年来根据许多学者的意见,将动物界分为如下34门： 原生动物门（Protozoa）、中生动物门（Mesozoa）、多孔动物门（Porifera）、扁盘动物门（Placo-zoa）、有刺胞动物门（ Cnidaria）、栉水母动物门（Ctenophora）、扁形动物门（ Platyhelminthes）、纽形动物门（Nemertea）、颚胃动物门（Gnathostomulida）、轮虫动物门（Rotifera）、腹毛动物门（Gastro-tricha）、动吻动物门（Kinorhyncha）、线虫动物门（Nematoda）、线形动物门（Nematomorpha）、鳃曳动物门（Priapula）、棘头动物门（Acanthocephala）、内肛动物门（Entoprocta）、兜甲形动物门（Loric－ifera）、环节动物门（Annelida）、螠虫动物门（Echiura）、星虫动物门（Sipuncula）、须腕动物门（Pogonophora）、被腕动物门（Vestimentifera）、缓步动物门（Tardigrada）、有爪动物门（Onychopho-ra）、节肢动物门（Arthropoda）、软体动物门（Mollusca）、腕足动物门（Brachiopoda）、外肛动物门（Ectoprocta）、帚虫动物门（Phoronida）、毛颚动物门（Chaetognatha）、棘皮动物门（Echinoderma-ta）、半索动物门（Hemichordata）、脊索动物门（Chordata）.
