满洲人看到明政府内部的危机日益激化,早就有灭亡明朝、占据中原的野心.他们一方面招降纳叛,对明朝官僚尽力收买,另一方面又经常派兵打进长城,在河北、山东等地烧杀抢掠,甚至包围京师,造成“己巳之变”,最深曾攻入济南.农民军占领西安后,满洲贵族曾经致书李自成,招诱农民军,要和农民军“协谋同力,并取中原”,遭到农民军断然拒绝.李自成攻占京师,推翻明王朝,满洲贵族大为震动.这时,他们便决定趁乱大举入关.驻守山海关的明朝总兵吴三桂,在李自成占领京师时,便向满清屈膝投降.得到满洲的帮助后,吴三桂又发布檄文,号召汉族地主阶级和富商大贾支持满洲贵族对农民军发起反攻.清统治者与吴三桂的结合,给农民军造成了不利的形势.李自成曾派人招降吴三桂,在吴三桂拒绝后,他立即率兵东征.大顺永昌元年（1644 年,清顺治元年）四月二十三日,李自成与吴三桂军激战于山海关前,一时难分伯仲.此时清军的猝然袭击,在一片石击溃了李自成派来增援的唐通部农民军,接着清吴联军合击李自成,农民军失利,李自成败退北京.清军正式入关.山海关败后,京师不能守,四月三十日,农民军放弃北京向陕西撤退.五月一日,清军进占京师.多尔衮奏请六岁的清顺治帝（清世祖）爱新觉罗福临迁都京师.同年九月,顺治帝从盛京迁都京师,“定鼎燕京”.
