1927年,北伐军挥师北上,听闻北伐军枪毙湖南叶德辉和湖北王葆心（王被杀是谣传）,6月2日同朋友借了五块钱,雇人力车至北京颐和园,于园中昆明湖鱼藻轩自沉.
毛泽东有诗云：“莫道昆明池水浅”,那里的水并不深,王国维跳进去,便一头扎到底.事实上并非溺毙,而是被湖底的淤泥朽草,塞满七窍,窒息而死.呜呼,一代学者,草草一生,就这样于污泥浊水中逝去,时年五十一岁.从他身上,翻出一纸遗书,上有“五十之年,只欠一死,经此世变,义无再辱”等字样.有人说,他这个“辱”,为死殉清廷,效忠逊帝；也有人说,他这个“辱”,与他亲家罗振玉有些什么纠葛.但不管什么缘由,当时及后来,都认为不值得.
