请问我在做荧光定量pcr的时候内参的ct值很低大约在35左右,而目的基因ct值在25左右

问题描述:

请问我在做荧光定量pcr的时候内参的ct值很低大约在35左右,而目的基因ct值在25左右
1个回答 分类:生物 2014-10-26

问题解答:

我来补答
看看你的GAPDH引物Tm多少,有可能是因为PCR条件适合目的基因引物对而不适合内参引物对吗?
再问: 不知道,我是个新手什么都不懂
再答: 那么童鞋,你还是找一个师兄师姐前辈高人带一下。网上这样问很难问出来滴。。。 Tm是DNA融化温度,就是双链打开成为单链的温度。跟引物序列中的GC含量有关,也受到你反应溶液中引物浓度和盐浓度的影响。在这个网站输入引物序列以后可以查到: http://frodo.wi.mit.edu/primer3/ 两个引物Tm差太多,或者PCR程序设置的Ta 温度不对应引物Tm, 都会导致PCR反应效率降低。而你的看家基因和目的基因引物有可能Tm不一样,那么同时反应,结果不能很好地代表真实表达量。如果问题是在这里,解决办法是重新设计看家基因的引物。 以上全部假设你的引物对在其他指数上没有问题。如果你的引物对本身设计得就不好,那也有可能造成你所遇到的问题,解决办法还是重新设计。
 
 
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