细菌、真菌和病毒的区别在于它们的结构：
病毒：无完整细胞结构,含单一核酸（DNA或RNA）型；
病毒寄生在活细胞中,掠夺别人的营养生存,危害大,如爱滋病毒,生存在人体免疫细胞,破坏人体自身保护.
细菌：是属于原核型细胞的一种单胞生物,形体微小,结构简单,无成形细胞核、也无核仁和核膜,除核蛋白体外无其他细胞器；
细菌广泛分布于土壤和水中,或者与其他生物共生.人体身上也带有相当多的细菌.据估计,人体内及表皮上的细菌细胞总数约是人体细胞总数的十倍；
细菌的营养方式有自营及异营,其中异营的腐生细菌是生态系中重要的分解者,使碳循环能顺利进行.部分细菌会进行固氮作用,使氮元素得以转换为生物能利用的形式.
真菌：是具有真核和细胞壁的生物；
真菌像细菌和微生物一样都是分解者,就是一些分解死亡生物的有机物的生物.真菌将生物分解为各类无机物,使土地肥力增强.
还有的真菌用于食物加工,例如酵母菌用于面包等加工,酿酒也需要真菌.
在农业、林业和畜牧业中,真菌又有有害的一面.真菌能引起植物多种病害,从而造成巨大的经济损失.
