半索动物又称隐索动物,是一些口腔背面有一条短盲管（口索）前伸至吻内的海栖类群.有人认为,半索动物应该列入动物界中最高等的脊索动物门里面去,因为半索动物与脊索动物的主要特征相似,如口索、背神经索前端有空腔、有咽鳃裂.但也有人认为,半索动物的口索很可能是一种内分泌器官,其腹神经索、开管式循环、肛门位于身体末端等特征与非脊索动物相似,所以另立一个独立的门较合适.半索动物大约仅有几十种生存种,分成2个纲：（1）肠鳃纲（如各种柱头虫）,（2）羽鳃纲（如头盘虫等）.
代表动物——柱头虫 (一)有两条纵走的神经索 有一条腹神经索和一条背神经索.背神经索在"领"中的部分有空腔,相当于背神经管的雏形).(二)消化管前端咽壁的背侧有许多对鳃裂.(三)口上方向前伸出一条短盲管——口索.(四)柱头虫其他特征:1.栖息于太平洋沿岸浅海泥沙中,生活方式与蚯蚓相似.最长的个体可以超过两尺.2.雌雄异体.变态发育,幼体与棘皮动物相似.是介于脊索动物与棘皮动物之间的过渡类型.
