MicroRNA (miRNA)：是含有茎环结构的miRNA前体,经过Dicer加工之后的一类非编码的小RNA分子（~21-23个核苷酸）.成熟的miRNA结合到与其互补的mRNA的位点通过碱基配对调控基因表达.与靶mRNA不完全互补的miRNA在蛋白质翻译水平上抑制其表达（哺乳动物中比较普遍）.然而,最近也有证据表明,这些miRNA也有可能影响mRNA的稳定性.使用这种机制的miRNA结合位点通常在mRNA的3’端非翻译区.如果miRNA与靶位点完全互补（或者几乎完全互补）,那么这些miRNA的结合往往引起靶mRNA的降解(在植物中比较常见).通过这种机制作用的miRNAs的结合位点通常都在mRNA的编码区或开放阅读框中.每个miRNA可以有多个靶基因,而几个miRNAs也可以调节同一个基因.这种复杂的调节网络既可以通过一个miRNA来调控多个基因的表达,也可以通过几个miRNAs的组合来精细调控某个基因的表达.
Small interfering RNA (siRNA)：是一种小RNA分子（~21-25核苷酸）,由Dicer（RNAase Ⅲ家族中对双链RNA具有特异性的酶）加工而成.SiRNA是siRISC的主要成员,激发与之互补的目标mRNA的沉默.siRNA在RNA沉寂通道中起中心作用,是对特定信使RNA（mRNA）进行降解的指导要素.siRNA是RNAi途径中的中间产物,是RNAi发挥效应所必需的因子.
