α螺旋,为蛋白质二级结构中最普遍的一种,它的形成可从一级结构氨基酸分子之间的关系延伸
形成因素
原则上,从氨基酸碳主链的构象来看,α-helix 可以左旋或者右旋,实际上所有已知的α-helix都是右旋,因为侧链和碳骨架之间的空间阻碍效应最少.即OH基团,NH基团和主链之间的稳定关系是形成α-helix必要条件,比如Proline 没有NH基团,而是环结构,不能形成α-helix.
其次,酸性或碱性氨基酸聚集的地方,侧链上同种电荷排斥造成α-helix不稳定.
再次,侧链上的氢键接受或者供给基团能够远离主链,避免破坏主链稳定,比如Serine,Aspartate,Asparagine因为其侧链影响主链而不能形成α-helix.
最好,glycine因为其R基团为H,构象太灵活而不能形成α-helix.
