番茄的主要病害有叶霉病、病毒病、晚疫病和蚜虫.
叶霉病：主要在叶片上发病,发病时叶片出现不规则形或椭圆形淡黄色褪绿斑,叶背病部初生白色霉层,随后霉层变为灰褐色或黑褐色绒状.
病毒病：病毒病是秋番茄的主要病害,发病时叶片上出现黄绿相间深浅相间条纹斑,叶脉透明,病株较健壮,略矮,叶片变小,叶面皱缩,中部销突起,边缘多向下或向上卷起,果实出现条形病斑.蚜虫是秋番茄病毒病传播的主要媒介,因此在防治病毒病的同时必须防治蚜虫.
晚疫病：从从下部叶尖或叶缘开始发病,初为暗绿色水浸状不整形病斑,扩大后转为褐色.果实染病主要发生在青果上,病斑初呈油浸状暗绿色,后变为暗褐色,销凹陷,边缘明显,云纹不规则,果实一般不变软,湿度大时其上长白霉.
