MATLAB中有两种M文件：一种称为脚本文件（类似于批处理语句）,这种是不是你说的m程序,另一种是M函数（类似于函数的概念）.
（1）脚本文件是由一系列MATLAB的命令、内置函数以及M文件等构成的文件,它可以由一般的编辑器进行编制,其结果保存在相应的M文件中.M脚本文件的实质为命令的集合,在MATLAB中执行M脚本文件时,MATLAB从文件中读取命令执行,完成用户的工作.
（2）MATLAB的函数与脚本不同,M函数的第一行为关键字function,函数第一次执行时将生成内存代码,生成的变量放在函数的工作区.在MATLAB中有大量的内置函数及大量的工具箱函数,使用它们可以完成大部分的工作；但由于不同的用户有不同的需要,MATLAB允许用户开发自己的专用或通用函数,以扩展MATLAB的函数应用.
（3）S-函数,主要针对Simulink 而言,是系统函数(System Function)的简称,是指采用非图形化的方式（即计算机语言,区别于Simulink 的系统模块）描述的一个功能块.用户可以采用MATLAB代码,C,C++,FORTRAM或Ada等语言编写S-函数.这里如果采用了MATLAB代码,通常是一个.m文件编好的MATLAB语言程序.
另外,S-函数由一种特定的语法构成,用来描述并实现连续系统、离散系统以及复合系统等动态系统；S-函数能够接收来自Simulink求解器的相关信息,并对求解器发出的命令做出适当的响应,这种交互作用非常类似于Simulink系统模块与求解器的交互作用.
