雨花石的成分是以二氧化硅为主,其中红色成分为铁离子和亚铁离子.雨花石是石质为玛瑙、蛋白石、玉髓、石英等的卵石,见于河床、河流阶地的沉积物之中,其中最著名的是南京六合横林镇（雨花石之乡）产出的雨花石.雨花石又分为细石和粗石两类,细石以玛瑙为主,石质细腻,颜色艳丽,磨圆度高,晶莹可爱；粗石质地较粗,以石英或变质岩为主,价值较低.美丽的雨花石中常可呈现各种山水、人物、鸟兽、树木等景象,使人遐想联翩,思绪入石,非常漂亮.由于雨花石种类繁多,它的成因和化学成分极为复杂.以玛瑙砾石为例,它来源于雨花石原生玛瑙.一般认为,原生玛瑙是由岩浆的残余热液形成的.这种热液充填在火山岩如玄武岩、流纹岩的空隙中,因空隙的形状不同,或成玛瑙球,或成玛瑙脉.经过自然力的作用,原生玛瑙脱落而出,再经过山洪冲击,流水搬运,磨成卵石.这就是我们所见到的在砾石层中的雨花玛瑙石.雨花石以其纹奇、色艳的自然美著称于世.它的圈状花纹是二氧化硅胶液围绕火山岩空隙、空腔,由内壁开始,从外向内多层次逐层沉淀而成.在其生长过程中,常常发生带色离子和化合物的周期扩散.原生玛瑙的主要化学成分是二氧化硅,其次是少量的氧化铁和微量的锰、铜、铝、镁等元素及化合物.它们本身具有不同的色素,如赤红者为铁,蓝者为铜,紫者为锰,黄色半透明为二氧化硅胶体石髓,翡翠色含绿色矿物等等；由于这些色素离子溶入二氧化硅热液中的种类和含量不同,因而呈现出浓淡、深浅变化万千的色彩,使雨花石及其艳丽秀美
