1、地理学：
从地质构造上讲,台湾与大陆曾经是连在一起的,只是后来由于地层下陷而出现海峡,将二者分隔开来.
福建与台湾地理位置毗邻和关系密切及拥有着历时逾二百年的闽台同省合治制度,国家一级文物“清初彩绘台湾地图”是大陆现存最早的一卷珍贵的手工绘制地图,绘制时间在乾隆52年之前,属军用综合性地图.从地图上可以看到,从福建移居台湾的居民点有同安厝、龙岩厝等,说明大陆台湾亲缘关系由来已久,台湾自古以来就是我国不可分割的一块领土.因为地图是当时的清朝政府绘制而不是民间所画,更说明台湾当时就是中国的领土.
2、动物学：
大约18000年前,当地球气温最低的时候,海平面平均下降140米.中国的渤海、黄海及东海的西部均为陆地,台湾海峡的平均水深为40多米,有的已露出成为陆地,与福建相连.而当时,地球正处于冰期,福建这里的气候可能接近现在北京、天津的气候,福建以北的地方气温自然更低,原先生活在那里的动物由于生存所迫,就往南迁徙.原来的海峡变成相对低洼的地区,一些源自福建的河流在此形成湖泊,此地水源充足,草木茂盛,成为北方南迁的动物的聚集地.特殊的自然环境和地理环境决定了当年台湾海峡生物的多样性,于是一个食草类动物、食肉类动物与人类共存的生态相对长时期平衡的生物链出现了.
两万年前台湾海峡形成陆地的部分地势比较平坦,不但适合寒温带地区的猛犸象等生存,也适合梅花鹿等寒温带动物生存,是生命的家园.现在发现的多达27个种类的台湾海峡动物化石真实、直接地为研究两万年前台湾海峡生物多样性提供了重要依据,以科学依据证明史前台湾海峡与祖国大陆连为一体的事实,具有特别重要的价值.
3、植物学：
两岸物种本为同源,这有很多的实物例证.据说台湾十大物种的源流有在大陆.
例如：台湾恒春是台湾相思树的原产地,可它的称谓典故却出在中原,说明台湾和大陆的文化也是一脉相承的.此树属含羞草科金合欢属的常绿乔木,具有喜光、喜温暖、不耐寒、耐瘠薄.相思树确有好几种,而台湾只有一种.与台岛相同的品种在大陆仅浙南闽东环海峡和海岛才有.同根同源,同叶同花,便有一种割舍不断的融融亲情.同样的水土,养育同样生命.这释因,就是说台湾和南麂与大陆真是太密切了,地理天候物种为同时所形,同时所具,并同时进化演变生长,虽地质板块开裂、漂移,但相承血脉不变,天质内涵不改.
4、文物学：
漫步闽南,很多文物古迹见证两岸同根同源.经考古人员考察,福建千多文物见证闽台渊源.
当台湾同胞能自由踏上祖国大陆时,不少人寻根谒祖,给祖坟扫墓,给祖祠上香,构成了一个个“血浓于水”的动人镜头.台湾祠堂众多,所祭先祖,祖籍无一不在大陆.
宗教文化是历史文化重要组成部分之一,中华文化对台湾的传播体现在宗教、艺术、文学、民俗、戏剧等等方面,其中,“神缘”把文化传播的鲜明印迹烙留在文物古迹上.
最有力的证明是：在厦大人类博物馆的史前文物中,台湾圆山遗址文物是在大陆仅能看到的一批台湾新石器时代的珍品,台湾大学和台湾“中研院”也有圆山遗址的文物.台湾的卑南文化遗址,那里的文物和厦大收藏的台湾台北圆山出土的小石锛、石斧、有段石锛、有肩石斧等器物一模一样,而更重要的证据是,这些器物和福建建阳、闽侯、长汀等地出土的器物形制和大小都非常相似.
地点不一样,但出土的器物却一样,这是最有力的证据,证明早在远古时代,台湾和大陆便有着密切的关系,大陆和台湾是同源的.
5、通俗同族：
考古材料证明,早在新石器时代,大陆居民就沿着连接大陆与台湾的大陆桥开始移居台湾,给台湾岛带来了与大陆一样的新石器文化.宋元时期,由于航海技术的发展,大陆开始逐渐向台湾大量移民,而明清时期,大陆的移民浪潮一浪高过一浪,移民带来的文化使台湾文化已经与大陆文化日渐趋同.
闽台的地缘关系最深刻地体现在远古时期的人类活动上.有同根同源的宗教、历史、文化渊源.如台湾已知最早的、距今约3万年前的“左镇人”就与福建发现的“东山人”等史前人类生活不仅年代相近,而且所使用的生产工具和生活习性都有许多共同之处.
台湾同胞大都是明末清初从闽南、粤东移民而来的,80%以上祖籍福建,因此台湾文化深受福建影响,在语言、民俗、节庆、建筑和民间信仰、戏曲艺术等许多方面都与福建同源同宗,闽台关系密不可分.
