怎么确定全长基因的功能区?

怎么确定全长基因的功能区?
假如我手中有一个全长基因,我怎么知道这是一个有着一定用途的基因,还是根本没有用途的基因?假如它发挥着功能,我怎么知道他的功能区域在哪里?是一定会在开放阅读框里吗?开放阅读框是从起始密码子开始算起吗?又假如我要把这基因转化到别的植物,我是需要把全长都转进去,还是只把功能区域转进去?
我克隆的这个基因是某个特定的基因，在许多植物上已经克隆出来过，但在我这个植物上还没有人克隆过。而且我是通过RNA反转录成CDNA后做的，我所指的全长就是我想要的那个基因的cdna全部长度。