你所说的PCR应该就是最常规的PCR,以DNA为模板,通过上下游引物,实现DNA的扩增
RT-PCR一般情况下是指反转录PCR（reverse transcription）,尽管有些资料上说实时荧光定量PCR也（realtime fluores-cence quantitative PCR）也简称RT-PCR,但是我觉得这是不对的,不推荐.基本操作过程是将所提取的RNA进行反转录,然后将所获得的cDNA作为模板,设计引物进行扩增,是一种检测基因表达的常用方法.
实时荧光定量PCR也就是Real-Time PCR,原理有点多,请自行百度百科,其最大的作用是检测样品中的初始DNA浓度.
至于三者的关系,RT-PCR和实时定量PCR应该都属于PCR,在RNA实验中,这二者都会应用到.例如你要比较2个组织中的某基因的表达差异,首先你要提取2个组织的总RNA,然后通过RT-PCR检测该基因是否在2个组织中有表达,然后通过实时定量PCR测定该基因在2个组织中的表达量是否具有显著性差异
