求助保守序列查找,引物设计

如果：你研究的物种没有这个基因,就可以按下面步骤做.
1：把你的基因名称粘贴在NCBI的蛋白质数据库中,进行搜索（这个比核酸数据库更保守一些）
2：根据搜索到的结果,看下面列出的信息,有没有和你研究物种是近缘的（从分类上说的）
3：下载10-20条左右的氨基酸序列（片段长度最好差不多、下载最好分布多个近缘物种）
4：保存成FASTA格式,用MEGA软件（或其他可对比软件）,进行比对
5：根据比对结果,找到保守序列（例如MEGA的显示是小星号,这个自己看一下软件就OK啦）
6：根据保守序列,按照简并引物设计原则,设计成对引物.（这个要学习一下如何从氨基酸翻译成核苷酸）
7：将序列给公司,进行合成.
8：回来,进行普通PCR扩增,如果有目的条带,则进行割胶回收,连接载体,克隆,测序
9：将测序结果进行BLASTX比对,看扩增的是否是你的基因,可用于全长扩增等后续实验
如果：你研究的物种有这个基因,就直接根据数据库中的序列设计引物就行啦.