be aware of .

这是一部分形容词的固定用法,没有原因,就是习惯这么用.
这种用法的格式就是系动词（be）+形容词+介词,可以看做是一个整体（但不是整体做一个形容词）.
类似的还有：
be fond of
be doubtful of
be sure of
等等……（当然后面不一定跟of）
句子：John is fond of fishing.
这种结构也可以这么用：
John is a man fond of fishing. 跟上面那个句子意思一样.这种情况下这个“形容词+介词”的结构相当于一个分词.这个句子用英语解释可以说成：John is a man liking fishing.
还有,有的时候后面的介词可以换成that,后面跟个从句.
比如I was aware that he's cheating.
关于第三个问题,作为A单词或词组的定义,B在句子中是应该可以取代A的.
比如：动词kick的解释是hit (sb/sth) with the foot,hit也是个动词.
再比如,形容词beautiful的解释是having beauty; giving pleasure to the senses or the mind.如果一个句子是She is beautiful,你完全可以用定义来取代：She is having beauty.
这里动词comprehend的解释其实是to become aware of（解释动词一般前面要加个to）,而后面的through the senses是补充说明的,意思是“通过感觉”.这里的through是跟the senses连接在一起的,跟aware没啥关系.