问题描述：
我的试验是要做一个基因多个位点的多态性,先提取基因组DNA,然后PCR扩增目的片段,之后酶切
酶切位点是哪里,怎么选择?我真的是新手,
问题解答：
我来补答
目前一般的方法是直接测序了
如果酶切,若是你知道多态位点的序列,可以根据这个序列选择内切酶；如果不知道,那就多尝试一下识别位点是4个bp的那几个常用的内切酶吧
再问： 是不是应该找切开多态位点附近的位点的酶啊？我试过dnaman ，没有找到啊
再答： 就是找应该切开多态位点的酶。 譬如，一段序列含有……GAATTC……，它能被EcoRI切开；而如果这个酶切位点恰好是多态位点，譬如GAATCC，那么EcoRI就切不开了，所以根据EcoRI后电泳条带可以判定基因多态性 所以，如果你能知道多态位点的序列，那么就可以有针对性地选择内切酶；如果你不知道，那么就得通过实验来尝试
再问： 我是在NCBI上输入rs序列号，然后就有包括多态位点的序列，用DNAMAN查过，没有多态位点附近的限制酶，怎么办？
再答： 没有合适的酶不大可能，你换一下另一种或几种多态序列看看 以上面的为例，你输入的是……GAATCC……没找到合适的酶，但如果输入的是……GAATTC……，那就能知道了 万一真的没有合适的内切酶，那就只能放弃这种方法了，但可以用其它方式，譬如你设计一个引物，它的3‘端最后一个碱基就是多态位点，这样，与这个引物严格匹配的能扩增，如果多态位点有变异，那么就扩增不出来
再问： 找到了三个位点的酶，另外有一个酶还没有商业化（北京NEC说的），其他两个位点找不到酶了，我用探针是不是可以啊
