为什么PCR引物可以决定被合成片段的大小

问题描述:

为什么PCR引物可以决定被合成片段的大小
PCR引物设计时一般要求引物的长度和GC比各是多少?这种要求的基本理论依据是什么
1个回答 分类:生物 2014-12-01

问题解答:

我来补答
因为GC之间有三个氢键,而AT之间只有两个氢键,因此GC含量越高,要打开氢键的能量就要求越大,即退火温度越高.PCR退火有的是根据GC含量估算Tm
更详细说明次料:
PCR引物应该保持合理的GC含量.含有50%的G+C的20个碱基的寡核苷酸链的Tm值大概在56~62℃范围内,这可为有效退火提供足够热度.一对引物的GC含量和Tm值应该协调.协调性差的引物对的效率和特异性都较差,因为降低了Tm值导致特异性的丧失.这种情况下引物Tm值越高,其错误引发的机率也越大.若采用太高的退火温度,Tm值低的引物对可能完全不发挥作用.在从一批在特定序列范围内已合成好的寡核苷酸中选择一对新的引物时,这种GC含量和Tm值的协调非常关键.一般来说,一对引物的Tm值相差尽量不超过2~3摄氏度,同时引物和产物的Tm值也不要相差太大,20摄氏度范围内较好.
再问: 那么 引物的长度为什么有限制呢?15-30个碱基之间是为什么?
 
 
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