首先 质粒的概念是 细胞“质”内的一个“粒”子,可见起名字中已经包含了其位置了.当然这是在发现质粒的早期概念
现在已发现,质粒不仅主要存在于原核,还存在于真核生物中.在原核细胞 因为没有核膜,因此包括宿主染色体在内的所有物质都存在于细胞质内（你可想象一锅八宝粥,核区和质粒都就在那粥中）,因此不存在是否质粒在不在核区的问题.目前发现的真核生物中的质粒多数存在于叶绿体中,因为据信叶绿体起源于原核生物.
酵母中的2um质粒是真正意义上的真核质粒 它的确存在于细胞核（有细胞膜的核）内,因为这个质粒跟还核内蛋白连在一起（类似于真核染色体性质）,但却是独立于染色体的.
其他的真核表达载体基本都是人工构建的,存在于细胞质内.
