主要可分为真菌、细菌和病毒三类.在其他微生物中,放线菌一般利用其代谢产物抗生素,而不直接利用其活体作杀虫剂.原生动物、线虫和立克次氏体等微生物的利用研究得很少,尚未实用化.
真菌杀虫剂 已发现的昆虫病原真菌约750种,寄生范围很广,但开发成杀虫剂的不多,已试验成功并有一定规模应用的有：利用白僵菌防治马铃薯甲虫、大豆食心虫、松毛虫和玉米螟；利用绿僵菌防治金龟子、孑孓；利用汤普森多毛菌防治柑橘锈螨；利用轮枝孢防治温室蚜虫；利用座壳孢防治粉虱和介壳虫等.
细菌杀虫剂 微生物杀虫剂中研究开发最成功的是利用芽孢杆菌作杀虫剂,主要品种为苏云金杆菌,已广泛应用于农作物、森林、粮仓和蚊蝇等的防治.苏云金杆菌发现于20世纪初,30年代开始实用化,50年代即有工业生产,70年代以来发展较快,80年代全世界年销售额超过2000万美元.中国在70年代已大量生产,有青虫菌、杀螟杆菌等许多商品名称.苏云金杆菌有很多变种,其芽孢内含毒蛋白晶体,通称δ-内毒素,是杀虫的主要成分.当孢子进入害虫消化道后,毒素被活化,使害虫麻痹瘫痪而死.由于各变种所含蛋白晶体的结构不同,其毒力和适用的害虫对象也不同.例如应用较广的寇氏变种,用于防治鳞翅目幼虫;以色列变种用于防治孑孓.其他已开发利用的细菌杀虫剂还有日本甲虫芽孢杆菌,用于防治金龟子幼虫颇有效.
病毒杀虫剂 寄生于农业害虫的病毒已发现约 200种,有些已被开发作为病毒杀虫剂.其中大多数属于杆状病毒的核多角体病毒,少数是颗粒体病毒.昆虫病毒有高度的专一寄生性,通常一种病毒只侵染一种昆虫,而对他种昆虫和人无害,因此不干扰生态环境.但由于病毒只能用害虫活体培养增殖,使大规模工业生产受到限制.已经小规模商品化的病毒杀虫剂多数用于防治鳞翅目害虫,例如棉铃虫、舞毒蛾、斜纹夜蛾、天幕毛虫、菜粉蝶等
