These shoes are comfortable ---- pretty.

ather than是对的.反对第一条回答.
句子意思是"鞋子是漂亮,但更重要的是其很舒适."
rather than 有很多种意思,视情况而定.
在句子里的意思是"与其说...不如说...",但为了翻译好听些,我就翻成"更重要的是".仔细体会一下,是一个意思.