给出一段DNA序列,类似下面这样.怎么判断哪些是编码区,哪些是非编码区,哪些是外显子哪些是内含子?...

问题描述:

给出一段DNA序列,类似下面这样.怎么判断哪些是编码区,哪些是非编码区,哪些是外显子哪些是内含子?...
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我只知道供子受子起始终止码是什么...里面有好多,分不清哪个是...我不是学生物的,生物学上是不是应该有更专业的方法呢?
1个回答 分类:综合 2014-11-01

问题解答:

我来补答
最直接的方法是去NCBI做blast比对,看看它的同源序列.
这是B.alcalophilus alkaline protease gene,里面没有内含子,根据比对结果可以看出起始密码子和终止子的位置
既然没有内含子,也可以使用一些软件去找ORF(开放阅读框),一般最长的那个阅读框就是编码区.
如果是未知序列,虽然也有一些算法可以判断编码区,但准确率就不高了.
 
 
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