生物进化论,简称进化论,是生物学最基本的理论之一.进化（Evolution）,是指生物在变异、遗传与自然选择作用下的演变发展,物种淘汰和物种产生过程.地球上原来无生命,大约在30多亿年前,在一定的条件下,形成了原始生命,其后,生物不断的进化,直至今天世界上存在着170多万个物种.生物进化论最早是由查尔斯·罗伯特·达尔文提出的,其在著《物种起源》时有详细的论述.进化论有三大经典证据：比较解剖学、古生物学和胚胎发育重演律.
生物进化论,甚至可以说整个生物科学,开始于1859年11月24日.在那一天,在经过二十年小心谨慎的准备之后,达尔文出版了《物种起源》.第一版印了一千二百五十本,在一天之内销售一空.一门崭新的学科从此诞生了! 但是,一门新的学科不会从天而降.在1859年,科学界已经有了大量的进化证据,做好了准备迎接进化论的诞生.这时候的进化证据归纳起来有动植物培养、化石记录、解剖比较、退化器官、胚胎发育和生物地理分布这几类.
生物进化可以分成三个层次：微进化（生物群体中基因频率的改变）、新种生成和大进化（从一个类型到另一个类型的跃变,比如从鱼类进化到两栖类）.现代综合学说完美地解释了微进化和新种生成,并认为由微进化和新种生成的研究所得的结果可以进一步推广到大进化.但是一些生物学家对这个推论表示怀疑,他们认为生物大进化可能有属于自己的机理.按照他们的观点,生物新类型的产生是在生物胚胎发育过程中基因突变的结果.胚胎发育时的微小突变可以导致成体的巨大变化.最近发育生物学的研究似乎证明了这一点：如果在胚胎发育过程中,某种基因的表达速度变慢,就会使鱼鳍变成肢足.可以预见,随着发育生物学的发展,越来越多的大进化难题将被解决. 对于如何评价这些新成果,进化生物学家们争论不休.持激进观点的人认为,这些成果已推翻了现代综合学说,它必须被新的学说所取代.现代综合学说也被称为新达尔文主义,因此这些新学说,比如中性学说,也就被称为非达尔文主义.而在持保守观点的人看来,这些新成果与现代综合学说并无本质上的冲突,也可以被综合到现代综合学说之中去.不管怎样,自从创立以来就备受攻击的现代综合学说仍然是进化生物学的主流学说.也许在不久的将来,就会出现综合了分子生物学、发育生物学等新学科的研究成果的“分子综合”学说.进化论创建一百多年来,本身就不断地在进化,将来也会不断地进化.进化论的进化没有止境.
