华佗由于治学得法,医术迅速提高,名震远近.他的同乡曹操,常患头风病,请了很多医生治疗,都不见效.听说华佗医术高明,就请他医治.华佗只给他扎了一针,头痛立止.曹操怕自己的病再发,就强要华佗留在许昌做自己的侍医,供他个人使唤.华佗禀性清高,不慕功利,不愿做这种形同仆役的侍医.加上他“去家思归”就推说回家乡找药方,一去不返.曹操几次写信要他回来,又派地方官吏去催.华佗又推说妻子病得厉害,不肯回来.曹操为此大发雷霆,专门派人到华佗家乡去调查.他对派去的人说：“如果华佗的妻子果然有病,就送给小豆四十斛,宽假限日,要是“虚诈”,就逮捕治罪.”不久,华佗被抓到许昌,曹操仍旧请他治病.华佗诊断之后,说：“丞相的病已经很严重,不是针灸可以奏效的了.我想还是给你服麻沸散,然后剖开头颅,施行手术,这才能除去病根.”曹操一听,勃然大怒,指着华佗厉声斥道：“头剖开了,人还能活吗?”他以为华佗要谋害他,就把华佗关到牢里去准备杀掉.曹操的一位谋士请求说：“佗方术实工,人命所悬,宜加全宥”.曹操不听,说：“不忧,天下当无此鼠辈邪?”竟然把这位在医学上有重大贡献的医生杀害了.临死,华佗把在狱中整理好的医著交给牢头说：“此可以活人”.没想到,这个牢头害怕,不敢接受.华佗只好忍痛,“索火烧之”.
华佗被害至今已一千七百多年了,但人民还永远怀念他.江苏徐州有华佗纪念墓；沛县有华祖庙,庙里的一副对联,抒发了作者的感情,总结了华佗的一生：
“医者刳腹,实别开岐圣门庭,谁知狱吏庸才,致使遗书归一炬；
士贵洁身,岂屑侍奸雄左右,独憾史臣曲笔,反将厌事谤千秋.
