影片讲述南极在渡过三个月的微热夏季后,企鹅纷纷从水下钻出来,开始他们为期九个月的冰面生活.上来的第一天,他们开始了长达十几天的漫长行走旅途,这支队伍在冰天雪地里不断前进,也慢慢壮大,最后竟不到头,几乎南极所有的企鹅都像约好一样聚集到这支队伍中.经过10几天的集体跋涉,他们终于选定一块“最适合”的冰面开始“爱的约会”,之后就是他们九个月艰辛、危机重重的繁殖生活.
《虎兄弟》和《熊的故事》都是人为设计的故事情节,但在《帝企鹅日记》里没有,一切都是企鹅“自编自导”的,影片讲述的完全是摄影机下静静地、慢慢地自然而然发生的事,因而很多“故事”,需要导演、摄影师有极大耐心和毅力才能捕捉到,才能呈现在观众眼前,这是最难的地方.
当所有的企鹅聚集在这块“爱的圣地”后,他们开始相互追逐寻找爱的伴侣,彼此中意的,便独处一个角落,进入“二人世界”.当然也有不幸的“三角恋”,但最后的结局还是非常完美,所有的企鹅都两两一对地耳鬓厮磨,交颈而眠,进行着爱的孕育.不久,雌企鹅就孵出蛋来,小心的“捧”在两只脚上,再用自己温暖腹部遮盖住它,避免落在寒冷的冰面上冻裂,这就是企鹅笨拙的孕育方式.他们靠月亮辨别时间,大约在三个月后小企鹅才会孵出来,这三个月是极其艰辛的,有时候,她们需要紧紧靠在一起,来抵抗不断呼啸而过的风雪和寒冷,两脚还要不停地钩拢着未出世的小生命,防止蛋碰到冰面上,而且,三个月不吃不喝,就这样日以继夜的站着,期待着,与风雪顽强地战斗,偶尔小心翼翼地移动下位置,取暖也好,活动活动冻麻的双脚也好,在强风暴雪中,有的企鹅不幸把蛋落在了冰上,尽管她们焦急的号叫,不停地用两脚拨动着蛋,试图捧起它,但只有少数才能失而复得,多数还是失败了,一些企鹅注定要失去这一年一次的机会,而伤心地提前离开.
雄企鹅也会和雌企鹅交换孵一下蛋,但他们主要的工作是在三个月结束前,在孩子出生的那天前,带回用来喂养小企鹅的食物.迟一天,他们的孩子就有可能在饥饿中死去,于是,雄企鹅又成群结队地进行“第二次行走”,他们冒着被海豹吃掉的危险,到较暖的冰面下,尽最大努力捕食小鱼放在嘴里.这时也是凶猛的海豹出入猎食的季节,这支企鹅队伍里注定有几支成为海豹的食物,但一个企鹅被吃的同时,也意味了其他企鹅就争得了充裕的时间,这是场残酷的生与死的抗争.
就这样,雄企鹅喂完小企鹅后再出发寻找食物,而刚生下来就能饱餐的小企鹅则在懵懵懂懂中开始了自己的第一次直立“行走”,但可怕的暴风雪很快就会夺去一些来不及躲闪在母亲温暖腹下的小企鹅的生命,一个母亲在悲鸣,她无法接受这个事实,并开始疯狂抢夺其他企鹅的孩子,在这个动人的故事中,摄影师捕捉到这场罕见的夺子的骚乱,最后,许多企鹅的干预下得到“镇压”.不久,另一场危险悄悄来临,秃鹰出现了,他看见了这些在冰面上玩耍的小而稚嫩的生命,在一次次突袭中,一些母亲又痛失爱子.生命真脆弱,但也公平.尽管我们知道食物链的道理,但那种怜惜与遗憾还是深深刻画观众心里.
