明朝究竟建立了一种怎样的机制,可以使能力平庸的皇帝（武宗和崇祯）能够在瞬间拿下刘谨,魏忠贤这样掌握

你的疑惑在于为什么明朝太监无法决定皇帝废立,而皇帝可以制服太监.
明代宦官主要掌握以下三种权力：1、批红权,即中枢决策权；2、司法权,即凌驾于三法司（大理寺、都察院、刑部）之上的司法权力；3、监军权,即充当监军,控制军队.权力极大,左右国家发展方向.
但是宦官的权力来源于皇帝,以上三种权力都是“代行皇权”,由于皇帝惰政才把自己的权力交与太监代行.也就是历史学家常说的“明代宦官专权是皇权专制机体上变异出来的毒瘤”.毒瘤是无法离开皇帝这个机体独立生存的,所以明代宦官必须依赖皇帝,才能生存.
而只要皇帝愿意,随时可以挥刀忍痛割去毒瘤,当然还会有新的毒瘤生出,但是皇帝是有“做手术”的主动权的.
唐代宦官之所以狂到了极致,在于他的权力来源于国家制度,有制度保证.并非完全来自皇帝.