某蛋白质分子的相对分子质量为10412，20种氨基酸的平均相对分子质量为128.在形成该蛋白质分子时脱去的水分子总相对分

根据多肽链的形成过程可知：在形成该蛋白质分子时脱去的水分子总相对分子质量为1620，说明生成的水分子为1620÷18=90．根据失去水分子数=肽键数=氨基酸数-肽链数，设肽链数为X，则氨基酸数=肽键数+肽链数．根据蛋白质相对分子质量=氨基酸平均相对分子质量×氨基酸数量-失去水分子数×水的相对分子质量可得：10412=128×（90+X）-1620，即可求出X=4．
故选：D．