I'm really glad to see you

呵呵~你问的这几个问题可以说不是一个问题~
首先,see之所以是原形是因为see在不定式结构中,to see you为不定式结构,to后面加动词原形,整个不定式表示目的.
而be后面的动词的确是要加ing,特别是表示进行时态的时候.但句中的be动词后面接了glad.glad为形容词,在句中充当表语成分.see也没有直接跟在be后面,所以see的形态根据不定式to去判断.
同样,It's a pleasure to meet you.也是一样的道理.不同的是,句中充当表语成分的是pleasure,为名词.但meet同样没有直接接在be后面,所以动词形态根据to不定式结构判断,为原形.