问题描述:
用perl处理
下面格式内容,把中间的大写字母的固定数值的配对率测出来,
根据中间配对率大小:把等于0.8的存入文件1.txt.
I001 195 TTGGT 205 225
E012 148 TTCGT 158 200
I001 1124 TTTCTT 1151 2978
E012 4 TAATGT 31 128
I002 17 AATTGACT 29 54
E023 5 AATTGACT 17 128
I003 16 TCGACTTAAT 35 65
E034 44 TGGACATAAT 63 200
配对率定义:设最佳匹配长度为m bp,若有k个碱基完全配对,则配对率为k/m.例如第一组序列配对率为:4/5=0.8,第二组为:2/6=0.3,第二组为:2/6=0.8
结果如下:
1.txt中有
I001 195 TTGGT 205 225
E012 148 TTCGT 158 200
I003 16 TCGACTTAAT 35 65
E034 44 TGGACATAAT 63 200
下面格式内容,把中间的大写字母的固定数值的配对率测出来,
根据中间配对率大小:把等于0.8的存入文件1.txt.
I001 195 TTGGT 205 225
E012 148 TTCGT 158 200
I001 1124 TTTCTT 1151 2978
E012 4 TAATGT 31 128
I002 17 AATTGACT 29 54
E023 5 AATTGACT 17 128
I003 16 TCGACTTAAT 35 65
E034 44 TGGACATAAT 63 200
配对率定义:设最佳匹配长度为m bp,若有k个碱基完全配对,则配对率为k/m.例如第一组序列配对率为:4/5=0.8,第二组为:2/6=0.3,第二组为:2/6=0.8
结果如下:
1.txt中有
I001 195 TTGGT 205 225
E012 148 TTCGT 158 200
I003 16 TCGACTTAAT 35 65
E034 44 TGGACATAAT 63 200
问题解答:
我来补答展开全文阅读