明初年靖难之役从北京打响,到朱棣打到南京时结束.问：朱棣在占领南京之后就占领全中国了吗?

楼上说的不对!
朱棣也是朱元璋的儿子,是有皇位继承权的.
当时朱棣是打着靖难的旗帜打到南京去的,也就是说他不是去抢皇位,而是因为有人把年幼的皇帝蛊惑了,打着皇帝的旗号乱发指令,朱棣是去清君侧的.（当然事实不一定是）
朱棣打败了那些奸臣的部队后,南京就投降了,然后朱棣去拜了朱元璋,然后去找建文帝,但是找不到了,所以就百般无奈的继位了.
所以从当时的局势来说,除了少部分知道真相的人之外,大部分老百姓是以为朱棣是救了国家,建文帝又不知是烧死还是被坏人掠走了,国不可一日无君,朱棣理应成为皇帝.那些宁死不屈的人都被灭了,比如那个被灭了十族的方孝孺.
所以从政局来看,朱棣是名正言顺的继位了,也就不存在继续抵抗的事.（你可以想想,好比你在家看电视,突然说某某继位了,你会不相信吗?）