定量PCR中,用内参基因进行标准化,为什么要用几何平均,

问题描述:

定量PCR中,用内参基因进行标准化,为什么要用几何平均,
1个回答 分类:生物 2014-11-16

问题解答:

我来补答
因为内参和目标基因的扩增效率有可能不一样,所以CT值不能直接相减.只能是内参间先算出相对量,目的基因也算出相对量(倍数),然后在用目的基因的倍数除以内参的倍数.
再问: 一共有三个内参基因,他们的几何平均是什么意思呢 你说的相对量是相对谁的呢
再答: 一次实验不会有3个内参基因吧,应该是3个样本吧。使用delta CT的方法,设其中一个为一,另外2个就是相对于这个为一的样本的相对倍数。
再问: 实验我不是很懂,主要是来源于这里 非常感谢!
再答: GAPDH是内参,其他2个是目标检测基因。 GAPDH的含量代表了RNA的含量。我专门发过一篇文章将如何计算的,你要是能看到原文 http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1021/bp060102e/abstract
 
 
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