实验二工具：
1 相似性比对用blast 注意限定条件,注意：blast时必须是fasta格式
2 对给出的氨基酸序列进行相似性比较,确定其编码的蛋白质 blast限定（swiss prot)
3 搜索不同物种的同源基因 用blast注意advanced加限制条件（organism; gene name) 利用blastn进行相似性同源基因搜索（others）
实验三工具：
1 分析下列未知序列,输出序列长度、载体序列的区域、可能使用的克隆载体都有哪些用VecScreen
2 分析下列未知序列的重复序列情况,输出重复序列的区域、包含的所有重复序列的类型、重复序列的总长度及Masked Sequence用
RepeatMasker
CENSOR
3 使用CpGPlot/CpGReport/Isochore工具,分析下列未知序列,输出CpG岛的长度、区域、GC数量、所占的百分比及Obs/Exp值用
EMBL→tools→sequence Analysis→在program上选择cpgreport
4 预测下面序列的启动子,输出可能的启动子序列及相应的位置用
fruitfly→Analysis Tools→Promoter Prediction-M.G.Reese
5 六框翻译用Genscan ORF(在ncbi里找）
6 限制性内切酶数据库用REBASE
7 引物设计工具用 primer3
8 酶切位点用 NEBcutter
实验四工具
1 Expasy中查找前体用swiss-port
2 分子量和等电点 用Expasy中的Compute pI/MW
3 前提的物理化学性质用Expasy中的Protparmam 包括蛋白质的相对分子质量,理 论pI值,氨基酸组成,原子组成,消光系数,半衰期,不稳定系数,总平均亲水性
4 前提的亲水性和疏水性用Expasy中的ProtScale
5 前提在各种蛋白酶和试剂处理后的内切产物用Expasy中的PeptideMass
6 查看信号肽直接Google→Signa1P
7 二级结构 直接Google→SOPMA
实验五工具
1 系统发育地位检索 用百度→tree of life
