将你需要比对的蛋白质序列选中,在BLAST界面Enter Query Sequence下面的大框中输入,如果是和数据库所有的蛋白质序列进行比对,再下面的Choose Search Set中选择你需要比对的数据库.Program Selection中的比对可根据个人需要进行选择 如果进行两两比对,或者多个序列的比对,在Enter Query Sequence框中选中Align two or more sequences,在弹出的框中,输入你需要比对的序列 最后点击BLAST即可. 结果得分越高,同源性越高,E值是期望值,得分越低同源性越高
