世界上突然出现了身长2至15m的神秘怪物“巨人”捕食着人类,面临着生存危机而残存下来的人类,在三重巨大的防护墙内侧确保了生活圈的安全.人们在这隔绝的环境里享受了一百多年的和平,直到艾伦·耶格尔十岁那年,60m高的“超大型巨人”突然出现,以压倒性的力量破坏城门,其后瞬间消失,巨人们成群的冲进墙内捕食人类.
讲的是一个名叫艾伦的少年,是一个亲生母亲被巨人杀掉后,父亲在他6岁时的进行人变巨人的实验,他小小的心灵中某样东西崩坏了,变成了杀人不眨眼的有着小孩外表的杀人狂,在杀了两名罪犯救了一女孩三笠.父亲给他注射一种药剂后艾伦丧失了部分记忆,继续变为普通人成长,在巨人入侵后,母亲被吃,想要杀掉所有巨人的他加入消灭巨人的团队,有了信赖的伙伴后,他执行任务为救由伙伴而被吃,出于对巨人的怨恨他变成了巨人活了下来.人们把他视为战胜巨人的关键,为寻找化巨人的方法,他带着父亲给他的钥匙和伙伴一起寻找至关重要的地下室,在此途中,死伤众多,并且发现他的伙伴是化为人的巨人,为了某个目的想要抓住他.
743年
谜样的巨人生物突然出现,将人类近乎捕食殆尽.
835年
艾伦、三笠、阿明出生.
844年
三笠的父母双亡后,被接至艾伦家照顾.
845年
玛利亚之墙南端的希干希纳区遭超大型巨人突破.玛利亚之墙遭巨人侵占,居民被迫迁往罗塞之墙内避难.
艾伦的母亲遭巨人杀害,父亲从此失踪,艾伦、三笠、阿明前往开拓地避难.
846年
玛利亚之壁夺还战失败后,从罗塞之墙到希干希纳区的领土被迫放弃,人类失去1/3的领土和2成人口.
多数难民在玛利亚之壁夺还战中丧生（事实上是政府为了减少失业人口所提出的政策）,其中包含阿明的父母（动画版为爷爷）.
847年
第104期训练兵团组成.艾伦、三笠、阿明从开拓地进入罗塞之墙的南方小队.
850年
第104期训练兵团毕业.
罗塞之墙南端的托洛斯特区再度遭超大型巨人入侵,大门被破坏.第104期训练兵团毕业生与驻扎军团联合对抗巨人.
在处于劣势的人类中,因艾伦的巨人化能力觉醒,出现希望.在托洛斯特区夺回战中,为使艾伦顺利将巨石堵住墙的洞口,以艾伦为中心,封锁巨人的入侵路线.原本牺牲甚多,最后因紧急回来的调查军团援助,洞口被封住,托洛斯特区夺回战扫荡巨人成功,为人类的首次胜利.
达里斯·萨克雷总统做为议长召开军事法庭,进行攸关艾伦性命的审判.最后艾伦交由调查军团管理.
第57次墙外调查中,因为牺牲过多不到一日便归返.此后艾伦必须交给宪兵团.
在这次的墙外调查中,由艾尔文指挥的第一次女巨人捕捉作战以失败收场.
第57次墙外调查结果,判定所属希娜之壁内的史托黑斯区宪兵团的亚妮·雷恩哈特为女巨人,进行第二次的女巨人捕捉作战.
野兽型巨人带领众多巨人入侵罗塞之墙,调查军团与巨人在厄特加尔城交战.因为尤米尔和随后赶到的汉吉班活跃的表现,野兽型巨人遂逃走.
第104期训练兵团的毕业生、目前所属调查军团的莱纳·布朗和贝特霍尔德·胡佛抵达罗塞之墙后,各自自白为盔甲巨人及超大型巨人,为带走艾伦和尤米尔而与调查军团交战.
