生物监测是理化监测的重要补充,对于评价环境质量状况有着十分重要的作用.理化监测一般只考虑瞬时污染状况,要做到长期连续监测,在经济上往往是不合适的.要了解污染的累积效应,采用生物监测更合适.同时,仅利用污染物质的浓度值来反映污染程度及危害也是不全面的,因为某些污染物质在环境中的含量极微不等于毒性极微,反之亦然.用生物监测进行配合,充分利用指示生物对污染物毒性反应的敏感性,便能较准确地反映真实的污染状况.
同理化监测相比,生物监测有自己的特点：生物监测能反映各种污染物的综合影响；理化监测是定期采样,结果不能反映采样前、后的情况,而水中生物,汇集了整个生长期环境因素改变的情况；有些水生生物对污染物很敏感,有些连精密仪器都测不出的微量元素的浓度,却能通过“生物放大”作用在生物体内积累而被测出.
生物监测也有自己的不足之处：生物监测不能定性和定量地测定水质污染；检测的灵敏性和专一性方面不如理化检测；某些生物检测需时较长
