哪个对?what are we do in our school or what are we to do in our

第二种说法正确.
be to do sth.,计划、想要或正式安排做某事.例如：
We are to discuss the report next Saturday.我们下星期六讨论这份报告.
此结构还可表示“应该,必须”的意思.例如：
You are to complete the work on schedule.你们必须按日程完成工作.
奥巴马就不会犯错误吗?小布什有时he和she还不分呢.
语法上第二种正确,至于他说的是不是What are we doing in our school?,不了解语境,我也不能妄加猜测.