问题描述：
【求助】Real-time PCR 引物设计求助
通常real-time PCR的引物要分别在两个外显子上,但我要研究的target gene 只有一个内含子,而且如果非要PCR产物跨过内含子的话所得出引物特别不好,不是有严重的错配就是有dimer or cross dimer,得到的最好的一对primer如下：sense:5'GTCTTTCGGATTTCGC Tm 47.9 ,GC 50 ,length 16 ,none(hairpin,dimer,false priming,cross dimer )anti-sense:5'TCGAGGATTTCAACACTGT Tm 47.2 ,GC 42.1 ,length19,found dimer(自由能-7.3) none othersproducts size：209我觉得这对引物的Tm值过低,产物又过长,请问各位前辈,这对引物能用于定量PCR中吗?如果我们设计的引物在一个外显子上对定量的影响有多大?有什么办法可以减小引物在一个外显子上对定量的影响?
通常real-time PCR的引物要分别在两个外显子上,但我要研究的target gene 只有一个内含子,而且如果非要PCR产物跨过内含子的话所得出引物特别不好,不是有严重的错配就是有dimer or cross dimer,得到的最好的一对primer如下：sense:5'GTCTTTCGGATTTCGC Tm 47.9 ,GC 50 ,length 16 ,none(hairpin,dimer,false priming,cross dimer )anti-sense:5'TCGAGGATTTCAACACTGT Tm 47.2 ,GC 42.1 ,length19,found dimer(自由能-7.3) none othersproducts size：209我觉得这对引物的Tm值过低,产物又过长,请问各位前辈,这对引物能用于定量PCR中吗?如果我们设计的引物在一个外显子上对定量的影响有多大?有什么办法可以减小引物在一个外显子上对定量的影响?
问题解答：
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